「ハコシップ」に乗り込んだキュービィたちは、宇宙を本来の姿に戻すため、モヤモヤに浸食された惑星たちを救います。

ハコシップでモヤモヤにむしばまれた惑星に向かいます。

ハコシップから惑星に降りるキュービィ。実は『ハコボーイ！』で仲間が降りてきた場所がハコシップだったのです。

惑星に降り立ったキュービィ。ここから冒険が始まります。