キャプテンクルールとその一味のクレムリン達に、ドンキーコングが誘拐されてしまいました。
そして、ドンキーコングの身代金を要求してきました。

もし、バナナの山を渡してしまったら、コングファミリーは、おくびょう者だと思われてしまいます。
そこで、ディディーとディクシーがドンキーの救出に向かうことになりました 。
行く手には、キャプテンクルールの一味が待ち受け、いろいろなワナも仕掛け られています。

この大冒険の旅に、２人は、勇敢に出発しました。