２台のゲームボーイアドバンスを、通信ケーブルで接続する事で対戦が可能です。（カートリッジも２本必要です。） 基本的な遊び方はストーリーモードと同じですが、自分のストーリーモードのセーブデータも使うことができます。この場合対戦で自分が育てている指揮官を使うことができるのです。

フォーメーションバトルは、味方・敵ともに、ゲームを始める前にマップの上に多くの部隊を配置し、ゲーム開始後は一切命令することなく、勝敗が決まるのを観戦するモードです。ゲーム開始前の部隊の召集と配置が勝負の決め手になります。

・１００人斬り ナポレオンに襲いかかる１００部隊の敵を、いかに短時間で倒すかを競います。

・タイム 敵の本拠地をいかに短い時間で占領するかを競います。

・持久戦 ナポレオンに次々と襲いかかる敵から、どれだけ長い時間耐えられるかを競います。

インザーギ奮闘記　 　├ １〜５話 　├ ６〜１０話 　├ １１〜１５話 　├ １６〜２０話 　├ ２１〜２５話 　└ 外伝１〜６	ゲームの概要　 　├ ゲーム概要 　├ 画面紹介1 　└ 画面紹介2	ストーリーモード　 　├ ゲームの基本的な流れ 　├ 指揮官紹介 　└ 称号について
	その他のモード　 　├ その他のモード 　└ モバイルコンテンツ	番外編　 　└ ナポレオン−効果音の世界