『ポケモンスナップ』では、ポケモンたちが住むビーチやトンネルなどの「コース」と、オーキド博士の研究所を行き来してゲームを進めます。 コースで撮った写真はオーキド博士に採点してもらいましょう。多くのポケモンを撮影したり、一定の条件を満たすと行けるコースが増えていきます。また、写真の総合得点が増えるとどうぐをもらうことができ、コースでいろいろなことができるようになります。