『トランスフォーマー コンボイの謎』は、1986年12月3日にファミコン用ソフトとして発売されました。物語は、サイバトロンの総司令官コンボイからスクランブルシティーの指揮官に任命されたウルトラマグナスが、悪の軍団デストロンに闘いを挑むところから始まります。トレーラーやウルトラマグナスにトランスフォーム（変形）し、敵を倒しながら進みましょう。

このゲームの主人公ウルトラマグナスは、トレーラーにトランスフォームしたり、トレーラーからウルトラマグナスにトランスフォームすることができます。それぞれの形態でできることが異なるので、ステージや敵によってタイミングよくトランスフォームすることが大切です。

ステージ中には、さまざまなパワーアップアイテム（エネルゴンキューブ）が登場します。デストロン軍団の激しい攻撃に対抗するためにも、ウルトラマグナスをパワーアップさせながら進んでいきましょう。

ステージの最後でウルトラマグナスを待ち受けるボスは、どれも巨大で攻撃も激しくなっています。ただし、ボスには弱点があるので、相手の攻撃をかわしながら弱点にビームを撃ち込みましょう。