敵旗艦に一騎討ちをしかけたり、敵旗艦から一騎討ちをしかけられると、それぞれの提督同士による1対1の戦いが行われます。
一騎討ち画面で「一騎討ちコマンド」を選び、攻撃や防御を互いに1回ずつ行うと1ターン経過します。相手の体力を0にすれば勝ち、主人公の体力が0になると負けです。なお、一騎討ちに勝つと海戦に勝利したこととなり、海戦が終了します。