マップ画面では、コマンドを実行することでゲームが進んでいきます。

進行システムには「リアル」と「コウタイ」の2つがあり、コマンドを実行するときのルールが異なります。

「リアル」では、敵味方が同時に行動します。 コマンド（移動や間接攻撃）の回数制限がないので、自軍のゾイドを1体だけ選び、そのゾイドに行動させ続けることも可能です。

「コウタイ」は、自軍のターン（手番）と相手のターンをくり返して進みます。 各ターンにはコマンドを実行することができ、2回コマンドを実行すると相手のターンに移ります。

自軍のゾイドを選び、「移動する」や「間接攻撃を仕掛ける」のコマンドを実行してゲームを進めていきます。

ゾイドにカーソルを合わせると表示されます。ゾイドに何も命令を出していない状態です。

ゾイドにカーソルを合わせてを押すと表示され、選んだゾイドを1マス移動させることができます。移動するマスをで選び、で決定してください。 敵のゾイドがいるマスに移動した場合は、バトルが始まります。 バトル

マークII化しているゾイドにカーソルを合わせてを2回押すと表示され、隣接していない3マス以内の敵ゾイドに間接攻撃を仕掛けます。間接攻撃をしたい敵ゾイドをで選び、で決定してください。 なお、隣接している敵ゾイドに間接攻撃を仕掛けると、通常のバトルになります。 間接攻撃

進行システムが「コウタイ」の場合、を押しながらを押すと「END」と表示されます。それ以上行動せずに自分のターンを終了したい場合は、ここでを押すとターンを終了できます。ターンを終了させたくない場合はを押してください。